过滤设备长期不用，需要把滤器清洗洁净、滤芯拔下，洗净烘干，用塑料袋封口寄存不要污染，滤器擦净寄存，不要损坏。换下来的滤芯要浸泡在酸碱洗液里，浸泡时间不要大于24小时，酸碱液温度普通在25℃-50℃。
建议酸或碱与水比时10-20%为好。蛋白质含量较高的滤液、滤芯尽量用酶溶液浸泡，清洗效果好，要清洗洁净再用蒸汽消毒，清洗消毒对水过滤器和枯燥过滤器很重要，滤芯消毒要留意控制时间和温度。
聚丙烯在高温度消毒柜里以121℃为宜，用蒸汽消毒在0.1MPa蒸汽压力下，以130℃/20分钟比较恰当，聚砜和聚四氟乙烯用蒸汽消毒，能够到达142℃、压力0.2MPa，时间30分钟左右比较好，如果温度过高，时间过长，压力过大，会损坏滤芯。
